真理號飛船在大宇宙中航行700多年，終於，在瓦力、伊娃的幫助下，真理號以超光速飛行，帶領着人類回到地球。艙門剛剛打開，人們邁着艱難的腳步走下飛船。抬眼望去，看見滿目瘡痍的地球，到處一片狼藉，臭氣熏天。大家流下了傷心的眼淚，決心要重建家園，恢復地球原來的模樣。
人們在機器人的幫助下建造家園，一棟棟高樓大廈拔地而起，如同一個個擎天巨人；一條條小河清澈見底，小魚小蝦在水中歡快暢遊；一塊塊土地無比肥沃，樹兒茁壯成長，到處充滿生機，而人們也過着美滿幸福的生活。
可惜，好景不長，瓦力的小寵物小強，出去遊玩時闖進了被人們遺忘的真理號飛船。它爬上了控制枱，來到了自控的身上。小強對紅色充滿好奇心，踩下按鈕，去不曾想觸動了自控的開關按鈕，自控從睡眠中醒來，眼前的一切讓他大吃一驚。人類違抗了指令，返回地球，致使他的任務失敗，這是決不允許的！
自控若有所思，自言自語道：“我一定要毀滅地球，把他們一個個捉回外太空，讓他們在外太空中生活，永遠不可以回來！”説完就重啟自動控制功能，控制了真理號飛船，並起動了所有在飛船上的“警察”機器人，並把它們改造成沖天炮機器，自控毀滅計劃就這樣開始了，人機大戰一觸即發。
自控以黑夜做掩護，指派機器人駕駛飛行器。飛行器是雞蛋形狀，這款飛行器具有消音功能，它偷偷地溜進人們的房間裏。從飛行器裏飄出一陣香氣，人類便沉沉睡去。機器人便將人類搬上飛行器，被綁架上了飛船並且被關了起來。每天都有許多人莫名其妙地消失，弄得人心惶惶！
一天晚上，瓦特，船長的兒子，晚上起牀喝水。他看見真理號飛船閃現出來一束光，瓦特內心充滿疑惑，飛船早已被封鎖，為什麼會有光束？他準備去一探究竟，瓦特拿起了家裏的菜刀，健步如飛地衝向真理號飛船。
他來到真理號飛船，發現大門是敞開的，於是躡手躡腳地走進去。瓦特看到了一隻龐大的機器人軍隊，嚇得他目瞪口呆！他躲過了機器人，繼續往裏面走，看到那些消失的人們。這時才恍然大悟，原來是被機器人抓走了。還聽見了自控在對他手下對機器人下指令。原來，這一切都自控的陰謀，瓦特心想：不行，我得尋找幫助，一起解救人類。於是，他馬上下樓，突然，走來一個機器人，慌忙之中一扔，砍爛了機器人，連滾帶爬地跑回了家。
死裏逃生的瓦特將自己的所見所聞告訴了父親，父親沉默了一會，父親説：“兒子，你去找伊娃和瓦力，它們一定會鼎力相助的！”瓦特一聽馬上騎車去找伊娃和瓦力。瓦力和伊娃此時正在看電視，還有很多全副武裝的機器人，瓦特把機器人的所作所為，一五一十地告訴了瓦力和伊娃，一列軍隊浩浩蕩蕩地來到真理號飛船上
人類和機器人扭打成一團，瓦特溜進了關着人類的房間，關閉電源，解救了所有人後。他們直徑奔向控制室，制服自控。瓦特一個箭步衝了上去，抓住了自控，機器人們也按住自控，自控旋轉起來，把所有人都甩了出去。突然，小強爬了出來，抓到紅色按鈕時，踩了下去，自控關機了！大家齊心協力地拆除了自控，並炸燬了真理號飛船。
下一季會發生什麼故事呢？讓我們敬請期待吧！