從前在密西西比河畔的一個普通小鎮上，有一個孩子叫湯姆索亞，他由姨媽撫養，是一個調皮的孩子。
鎮上有一個孩子叫做哈克貝利費恩，是一個流浪兒，他遊手好閒，大人們都不喜歡他，可湯姆和他卻是好朋友。
有一次他們為了測試膽量，約好去墓地埋死貓，卻看到了意想不到的一幕：醫生，印第安人印江喬埃和莫夫波特在爭吵。在撕打中，印江喬埃把醫生殺死了，又嫁禍於暈倒的波特。湯姆和哈克嚇壞了，怕喬埃追殺他們倆，立了血誓，絕不泄密。
波特被捕了，湯姆十分內疚，常常去看他，此時的湯姆事事不順，他覺得沒有人關心他，於是他就和哈克，喬一起到傑克遜島上當“小海盜”，但沒過多久，他們便發現鎮上的人在找他們，最終，他們仨在鎮民為他們舉行葬禮時回來了。夏天來臨，卻使湯姆更緊張：法官即將審判波特。湯姆戰勝了恐懼，説出了兇手，但兇手卻逃走了。
後來，湯姆提出一個主意：尋找寶藏。他又叫上了哈克，兩人一起去鬼屋尋寶，卻意外發現了印江喬埃的不義之財。
在湯姆，貝琪和別的孩子野餐時，哈克得知印江喬埃要加害道格拉斯寡婦，幸虧哈克及時給老威爾斯報信，才避免了悲劇。
此時，湯姆和貝琪卻在山洞中迷了路，他們還意外遇到了喬埃，喬挨卻撒腿就跑。湯姆用風箏線探索出了一個出口，他回去説服了貝琪，終於，湯姆和貝琪走出了山洞。村民把洞口封死了，湯姆説印江喬埃還在洞中。當他們找到喬埃時，喬埃已經被餓死了！
後來，湯姆和哈克再次回到山洞，找出了寶藏，成為了一段傳奇。